L'APTX 4869 è una tossina derivata dalla formula sperimentale sviluppata da Sherry. E' usata dall'Organizzazione come veleno letale.
APTX è l'abbreviazione di "apotoxin" e, come suggerisce il nome, comporta l'attivazione apoptosi che porta alla morte a causa della distruzione delle cellule.
In casi molto rari però, la tossina non provoca la morte ma riporta la persona che lo ha ingerito ad uno stato fisico ottimale facedole diminuire l'età. Shinichi Kudo è una delle "vittime sopravvissute" della tossina. Più tardi anche Shino Miyano (Sherry), nel tentativo di suicidio diventa una "vittima sopravvissuta".
In tutta la serie sono presenti diversi casi di persone che pur avendo ingerito l'apotoxin non muoiono.
Il numero 4869 presente nel nome della tossina sta per "shiyaroku": shi = 4; ya = 8; ro = 6; ku = 9.
"Shiyaroku" è il nome giapponese che sta per "Sherlock".